Cơ cấu tổ chức của UBND xã từ ngày 1/7/2025 bao gồm: Chủ tịch, Phó Chủ tịch và các Ủy viên. UBND xã có không quá 2 Phó Chủ tịch. Các Ủy viên bao gồm người đứng đầu các cơ quan chuyên môn thuộc UBND xã, Ủy viên phụ trách quân sự và Ủy viên phụ trách công an xã. Sau sáp nhập, cơ cấu tổ chức của UBND xã An Phú Tân được kiện toàn nhằm tối ưu hóa bộ máy hành chính, đảm bảo năng lực thực thi nhiệm vụ trong bối cảnh địa bàn và quy mô dân số đã thay đổi. UBND xã sẽ tiếp tục thực hiện các chức năng, nhiệm vụ quản lý nhà nước trên mọi lĩnh vực.